【前言】
首先聲明，我并不是專業(yè)NAS玩家，沒有太多精力去折騰虛擬機(jī)，去部署各種管理工具，所以一臺(tái)NAS對(duì)于我而言，可能會(huì)更貼近于生活、工作上的使用。我手中也有迷你主機(jī)，也想過(guò)自己去折騰打造一臺(tái)ALL in One，但是我在張大媽看到的動(dòng)不動(dòng)上萬(wàn)字的DIY教程，確實(shí)直接勸退了我。于是，成品NAS才是我最終歸宿。
在這之前我也知道大家說(shuō)的，NAS只有群暉和其他，但是當(dāng)我真正入手了群暉之后，發(fā)現(xiàn)似乎并不是那么簡(jiǎn)單明了，雖然不得不承認(rèn)的是群暉軟件是優(yōu)勢(shì)、更完善，但是某幾個(gè)功能就得整一個(gè)手機(jī)APP這一點(diǎn)確實(shí)讓我有點(diǎn)無(wú)力吐槽，而且在傳輸以及一些使用界面上，我確實(shí)感覺對(duì)于我而言，對(duì)比之后入手的極空間和綠聯(lián)這兩款國(guó)產(chǎn)NAS而言，我會(huì)更愿意使用后者。
【DXP4800撿漏】
為什么說(shuō)撿漏，是因?yàn)樵?月份剛推出新品的時(shí)候，新系統(tǒng)層面的BUG直接損失了部分用戶，而我也在二手平臺(tái)用相對(duì)較低的價(jià)格淘到了這款產(chǎn)品，在我當(dāng)時(shí)的理解來(lái)看，我是認(rèn)為綠聯(lián)既然打算從底層邏輯上對(duì)系統(tǒng)進(jìn)行升級(jí)改革，那么作為一個(gè)公司大方向上的決定，無(wú)論剛推出的時(shí)候有多少槽點(diǎn)，在接下來(lái)的時(shí)間一定會(huì)最快速度解決并優(yōu)化，而且肯定比之前好用。
等了一個(gè)月時(shí)間，我只能說(shuō)我賭對(duì)了，UGOS Pro系統(tǒng)不管是功能豐富性、還是系統(tǒng)穩(wěn)定性都已經(jīng)非常不錯(cuò)了，從綠聯(lián)新系統(tǒng)這次推倒重構(gòu)的做法來(lái)看，頗有大刀闊斧的意味，而且這一個(gè)月內(nèi)固件更新、功能新增進(jìn)度，我相信綠聯(lián)那群研發(fā)人員估計(jì)都瘦了一圈。
有些人說(shuō)，老用戶不如狗，為什么現(xiàn)在還沒有更新，這個(gè)我咨詢了一下相關(guān)人員，反饋的是后續(xù)DH2600和DX4600系列肯定也是同樣可以更新升級(jí)的，再等等就可以，如果你著急想嘗鮮，也可以直接寄給綠聯(lián)官方升級(jí)（包郵）。
【系統(tǒng)開放，應(yīng)用功能擴(kuò)展】
說(shuō)實(shí)話，很多人就在比較國(guó)產(chǎn)的極空間和綠聯(lián)怎么選？放在上半年新系統(tǒng)沒推出的時(shí)候，我給別人說(shuō)的是，極空間在軟件層面稍稍領(lǐng)先于綠聯(lián)，而在硬件以及做工上，似乎綠聯(lián)更勝一籌，更新了系統(tǒng)之后，起初BUG事件直接讓綠聯(lián)完全沒有了贏了機(jī)會(huì)，可是經(jīng)過(guò)了不斷更新之后，現(xiàn)在的綠聯(lián)在使用層面上，底層邏輯的不同，讓功能應(yīng)用更加豐富了，那么這個(gè)時(shí)候的我，賭贏了也賭對(duì)了，實(shí)際體驗(yàn)還是很不錯(cuò)的！
這一次綠聯(lián)推出的新產(chǎn)品我認(rèn)為有兩個(gè)地方值得關(guān)注：一是大家討論的新系統(tǒng)，之前的綠聯(lián)UGOS系統(tǒng)基于openwrt開發(fā)而來(lái)，而新系統(tǒng)UGOS Pro是基于Debian 12系統(tǒng)開發(fā)而來(lái)，并且Linux內(nèi)核版本是最新6.1，并且Debian是通用操作系統(tǒng)，廣泛應(yīng)用于桌面環(huán)境、服務(wù)器、開發(fā)環(huán)境等，簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)，Debian是標(biāo)準(zhǔn)Linux發(fā)行版，許多系統(tǒng)也是基于它開發(fā)的，單就以NAS系統(tǒng)來(lái)說(shuō)，像群暉、威聯(lián)通、unRaid都是基于標(biāo)準(zhǔn)Linux發(fā)行版開發(fā)而來(lái)的，綠聯(lián)這次的調(diào)整，也就說(shuō)明之后的布局方向還是比較大的。
二是型號(hào)之多，從綠聯(lián)DXP2800到最高的DXP8800 Pro以及全閃存DXP480T Plus等NAS采用的處理器從N100到8505，再到1215U、1235U、1255U，基本上涵蓋了一眾優(yōu)秀的CPU，你甚至不敢想象還有萬(wàn)兆網(wǎng)口、雷電4接口、SD卡接口等等，至于不同的CPU各自的優(yōu)勢(shì)，給大家整理了一下放在了文中。
然后我個(gè)人比較推薦的是，如果是家庭使用，和我這種一樣情況的話，沒有太多折騰必要，可以選擇4800完全夠了！
安裝使用前的準(zhǔn)備很簡(jiǎn)單，學(xué)習(xí)成本幾乎為零，這對(duì)于小白來(lái)說(shuō)很友好，一切從簡(jiǎn)，大家可以選擇套餐的硬盤，也可以自行購(gòu)買，一般剛開始4+4的組合形式就差不多夠用了，推薦RAID1的模式，這樣的話對(duì)于數(shù)據(jù)更有保障。手機(jī)掃描NAS底部二維碼開始引導(dǎo)，引導(dǎo)過(guò)程比較簡(jiǎn)單，一步步過(guò)就可以了。
綠聯(lián)NAS的系統(tǒng)也是非常簡(jiǎn)約易上手，支持用戶刷機(jī)，完全本地化的部署可以自定義管理員賬號(hào)及密碼，還可以通過(guò)綁定手機(jī)號(hào)的方式體驗(yàn)服務(wù)。手機(jī)APP做的也是非常不錯(cuò)，實(shí)現(xiàn)了電腦端功能的全部對(duì)應(yīng)，而且方便用戶備份手機(jī)中的照片等數(shù)據(jù)，操作起來(lái)也是非常簡(jiǎn)單。
對(duì)于應(yīng)用的使用，我們可以直接進(jìn)入到應(yīng)用中心，選擇自己想要部署的應(yīng)用進(jìn)行下載安裝，這個(gè)過(guò)程有點(diǎn)像當(dāng)時(shí)使用威聯(lián)通、群暉的感覺，如Docker、虛擬機(jī)、同步等等都可以在這里自定義安裝，不過(guò)在安裝過(guò)程中只能等第一個(gè)安裝完成后才能開始下一個(gè)，對(duì)于剛開始進(jìn)入，如果想要一次性安裝多個(gè)，是無(wú)法實(shí)現(xiàn)的，這屬于一個(gè)小小可以改善的建議。而且目前可以使用的應(yīng)用并不多，能滿足基本使用功能，相信后續(xù)還會(huì)有更多的開發(fā)。
【影視墻，家庭娛樂中心】
這么說(shuō)吧，自從有了小孩之后，我們?nèi)ル娪霸嚎措娪暗拇螖?shù)已經(jīng)一只手都數(shù)的過(guò)來(lái)了，除了過(guò)年或者真正剛好有那么一次我和媳婦都有時(shí)間，小孩丟給父母，才能出去瀟灑一次。所以，更多的時(shí)候只能在家看看電影增加一點(diǎn)娛樂氛圍，小孩9點(diǎn)左右睡著之后的時(shí)間，才是屬于我們兩人的。
綠聯(lián)DXP4800這次的影視中心是由原來(lái)的[云影院]衍變來(lái)的，所以基本功能大差不差，但是細(xì)節(jié)上處理更好了，UI界面和使用體驗(yàn)都有大的提升，NAS最經(jīng)典的影視墻可以更直觀的展示影片內(nèi)容等等，在我們下載好的影片文件夾中，對(duì)應(yīng)的在影視中心設(shè)置媒體庫(kù)的時(shí)候，就可以選擇自帶的AI進(jìn)行刮削，當(dāng)然，你也可以按照教程進(jìn)行數(shù)據(jù)源TMDB的配置，可以實(shí)現(xiàn)更精準(zhǔn)的刮削效果。
TMDB（The Movie ）是一個(gè)公開的影視數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站，擁有著豐富的電影、電視節(jié)目、演職人員的影視信息數(shù)據(jù)。我們?cè)谧铋_始配置媒體庫(kù)信息的時(shí)候就有一個(gè)[如何申請(qǐng)]可以進(jìn)行點(diǎn)擊進(jìn)入到綠聯(lián)云知識(shí)中心，按照教程一步一步操作即可。
但是值得注意的是：在獲取API密鑰的時(shí)候，有一個(gè)個(gè)人信息填寫，這里的應(yīng)用簡(jiǎn)介位置一定要注意填寫成英文，我在初期使用配置的時(shí)候直接寫的中文最后是無(wú)法提交的，會(huì)出現(xiàn)驗(yàn)證錯(cuò)誤。英文內(nèi)容其實(shí)無(wú)所謂，這里給大家一個(gè)參考的：To satisfy needs and a movie wall display on the UGREEN NAS.（為了滿足個(gè)性化定制需求，實(shí)現(xiàn)綠聯(lián)NAS的影視墻展示）
完成之后你就可以看到非常詳細(xì)的影視墻介紹了，不僅包括最新的海報(bào)封面、演員信息、甚至豆瓣評(píng)分等等，同時(shí)支持本地字幕加載、手動(dòng)字幕、外掛字幕添加等等，解決了藍(lán)光視頻字幕的添加需求，同時(shí)還支持ISO視頻目錄播放，除了可以直接電腦端在線播放，用戶也可以在手機(jī)端、電視端體驗(yàn)高清影視播放，滿足更多實(shí)用場(chǎng)景的需求。
【相冊(cè)管理，AI賦能】
就在上個(gè)星期，我嫂子打算帶著小孩和我姐姐他們一起去寧夏轉(zhuǎn)西安一圈在回來(lái)，去之前她還問我，有沒有什么合適的可以用來(lái)記錄存儲(chǔ)照片的好用的工具，說(shuō)她的百度云每年花不少錢，但是實(shí)際體驗(yàn)還是差了一點(diǎn)。而我姐姐采取的是更加不明智的做法，她將照片存放在了QQ空間，雖然現(xiàn)在我還能在她空間找到我五六歲的時(shí)候的照片，但是完全模糊不清。
作為這個(gè)大家庭中唯一愿意用相機(jī)記錄生活的我，逢年過(guò)節(jié)基本都會(huì)給親戚拍照紀(jì)念，同時(shí)作為工齡一年半的奶爸，對(duì)于小孩的成長(zhǎng)記錄也是十分看重的，我其實(shí)之前弄NAS也是為了更好的存儲(chǔ)這些以后值得懷念的照片。綠聯(lián)DXP4800在實(shí)際使用中，我會(huì)做這么幾步：
一是手機(jī)相冊(cè)的同步，這是最主要的照片來(lái)源，因?yàn)槿粘Ｉ钪懈嗟氖鞘謾C(jī)直接就拍照記錄了，一方面解決了擔(dān)心照片丟失的問題，二來(lái)更大程度上緩解了手機(jī)內(nèi)存不足的問題，這么說(shuō)吧，我媳婦手機(jī)存了8000張照片，我的上一臺(tái)手機(jī)存了5000張照片，而現(xiàn)在，新手機(jī)也再次達(dá)到了5000，加上微信聊天記錄一直沒刪除，手機(jī)已經(jīng)多次提醒需要清空內(nèi)存，否則無(wú)法使用的消息。
另一方面則是自己通過(guò)相機(jī)拍攝的照片，如果是需要利用修圖軟件的，我就會(huì)導(dǎo)入到電腦完成修圖之后再放到NAS，因?yàn)樵谕痪W(wǎng)絡(luò)狀態(tài)下，所以速度非常快，而一些不需要修圖的照片，我是可以直接在機(jī)器前面板底部的接口端插入SD卡進(jìn)行拷貝的，所以整體而言還是很方便。
而基于AI功能，對(duì)于照片的管理也讓人一目了然，用戶可以選擇需要的模型點(diǎn)擊下載后應(yīng)用于個(gè)人圖庫(kù)，可以添加的模型包括"重復(fù)/相似照片識(shí)別"、"場(chǎng)景識(shí)別"、"人物識(shí)別"、"面部識(shí)別"、"寵物識(shí)別"、"文字識(shí)別"等等,并且模型可以升級(jí)和學(xué)習(xí)，能夠根據(jù)用戶的使用習(xí)慣來(lái)打造更適合自己的圖庫(kù)。
對(duì)于小孩的一些的一些照片還可以直接分享，這樣的話也不存在畫質(zhì)壓縮的情況。直接發(fā)給小孩外婆，或者說(shuō)對(duì)于我之前拍攝的大家庭的合照，也是直接可以分享，大家可以按需自取進(jìn)行下載即可。
【生產(chǎn)力提高】
其實(shí)對(duì)于生產(chǎn)力方面我有兩點(diǎn)感受，首先是我媳婦非常喜歡這個(gè)，對(duì)于她們財(cái)會(huì)人員而言，下班處理事情是常有的事，所以除了辦公室一臺(tái)電腦，她自己還買了一個(gè)筆記本用于工作，但是更多的僅僅是表格上的處理，在線文檔這一功能很好地解決了這一問題，（騰訊的在線文檔收費(fèi)之后，我感覺這個(gè)更香了）。
另外一個(gè)就是控制面板處的對(duì)于文件夾的共享，一些圖片、工作上需要處理的事情，直接共享，生產(chǎn)力提升確實(shí)是嘎嘎的。
【一些其他要說(shuō)的】
其實(shí)整體使用下來(lái)，和老款比較有兩個(gè)明顯的點(diǎn)，系統(tǒng)更新之后操作體驗(yàn)會(huì)好很多，另外就是無(wú)論是影視播放還是文件瀏覽，尤其是我那些原圖幾十兆的照片，手機(jī)端、PC端查看都要比以前更流暢，這除了系統(tǒng)本身的原因之外，處理器的提升也是一個(gè)方面，N100畢竟還是非常不錯(cuò)的。
另外8GB的DDR5內(nèi)存，以及旁邊的兩個(gè)M.2 2280 NVMe SSD插槽都可以為后續(xù)的性能提升做準(zhǔn)備。背面接口足夠豐富，HDMI2.0接口可以外接電視或者顯示器，實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)視頻輸出。一個(gè)USB3.2接口，兩個(gè)USB2.0接口。還配備了兩個(gè)2.5G網(wǎng)口，可以用來(lái)做鏈路聚合，實(shí)現(xiàn)帶寬雙倍疊加。前面板設(shè)置了開關(guān)機(jī)鍵，USB-A口，USB-C口和SD卡讀卡器，不得不說(shuō)綠聯(lián)是聽勸的，網(wǎng)友在論壇提的建議被采納了，SD讀卡器非常方便攝影師群體，硬盤倉(cāng)做了鎖扣設(shè)計(jì)防止意外拔出，不過(guò)我個(gè)人還是會(huì)更喜歡以前的蓋板設(shè)計(jì)，一體性更強(qiáng)。
還有一個(gè)不錯(cuò)的就是網(wǎng)盤下載功能，直接實(shí)現(xiàn)全網(wǎng)站多網(wǎng)盤直接下載，你要知道，NAS本身功耗就低，這樣的話7*24小時(shí)不間斷工作，是完全能滿足你對(duì)于電影娛樂需求的下載的，并且，資源豐富！
【總結(jié)】
雖說(shuō)這次綠聯(lián)的新系統(tǒng)經(jīng)歷了這么一次意外事件，但是綠聯(lián)能從最根本的系統(tǒng)進(jìn)行大改造升級(jí)，現(xiàn)如今幾乎是兩三天就有一更新來(lái)說(shuō)的話，我覺得還可以再等等，還是那句話，大方向?qū)α耍敲纯隙ü揪统@個(gè)目標(biāo)在做，后續(xù)只會(huì)更好用，對(duì)于消費(fèi)者而言，后續(xù)肯定是利好的！
2022年4月_生信入門班_微信群答疑筆記
做教學(xué)我們是認(rèn)真的，如果你對(duì)我們的馬拉松授課（直播一個(gè)月互動(dòng)教學(xué)）有疑問，可以看完我們從2000多個(gè)提問互動(dòng)交流里面精選的300個(gè)問答！
強(qiáng)烈建議你推薦給身邊的博士后以及年輕生物學(xué)PI，多一點(diǎn)數(shù)據(jù)認(rèn)知，讓他們的科研上一個(gè)臺(tái)階：
下面是2022年4月_生信入門班_微信群答疑筆記
上一期答疑筆記是：
請(qǐng)問老師有沒有相關(guān)的書籍推薦呢，跟課程相關(guān)的書籍。
請(qǐng)問找個(gè)消息里面騰訊微云和百度網(wǎng)盤，選擇其中一個(gè)就行，對(duì)嗎？
內(nèi)容是一致的，選一個(gè)即可
你好，遇到了一個(gè)問題
用替代軟件xftp，準(zhǔn)備工作里面的網(wǎng)盤里有
IGV安裝以后雙擊打開，顯示我的電腦沒有JAVA文件。我看了答疑里面，沒有這個(gè)問題的解決方案。
試試到igv官網(wǎng)下載新版本
請(qǐng)問這兩個(gè)下載哪一個(gè)？
左邊的
請(qǐng)問一下，r code里面提到使用鏡像是什么意思，不用鏡像會(huì)有什么影響么
不使用下載速度會(huì)慢，甚至失敗。如果你人在海外的話，在自己的電腦上安裝，建議找一個(gè)離自己近的鏡像地址。當(dāng)然你也可以先試試看我們給大家推薦的這個(gè)，如果下載速度肉眼可見的非常慢，那再去找其他的鏡像。
R studio 打不開咋回事，是不是要安裝在c盤才可以啊？
我們建議你R和Rstudio都裝C盤
請(qǐng)問R之前已裝在其它盤可以嗎？能使用
如果你一直沒有報(bào)錯(cuò)，而且你比較堅(jiān)信自己解決問題的能力，也可以不用調(diào)整的
我這個(gè)安裝r包 run的時(shí)候咋是這樣的
看一下視頻，從第一行開始，一下下點(diǎn)run，留意左下角窗口的輸出信息，如果返回大于號(hào)，且沒有error，就繼續(xù)點(diǎn)run
我這個(gè)r包 一直安不上
從這個(gè)日志來(lái)看，應(yīng)該是你已經(jīng)安裝成功了呀，沒有error就不用管
15號(hào)那天的最后一部分內(nèi)容，二進(jìn)制文件安裝，源代碼安裝，java編譯的軟件，聽不懂看不懂，對(duì)下周轉(zhuǎn)錄組的課程影響大嗎？
不大
點(diǎn)第一行的時(shí)候出現(xiàn)這個(gè)，要等大于號(hào)出現(xiàn)嗎？
你按一下ESC鍵，再重新run，你的代碼可能復(fù)制補(bǔ)全，或者你run的時(shí)候沒有一行行run
助教，你好。我的Typora安不上，下載了早期版本也不行。
去typora官網(wǎng)下載適配版，實(shí)在不行那就先跳過(guò)，這個(gè)軟件我們不用了
item2需要安裝嗎？
termus 和 iterm2，二選一，推薦前者
MacBook M1可以安裝R嗎？
M1 在安裝R語(yǔ)言的時(shí)候，請(qǐng)選擇云盤版本，而不是去官網(wǎng)自己下載
需要安裝嗎
需要
還有一個(gè)jre開頭的文件也需要安裝嗎
可以不用
igv 安裝網(wǎng)盤的還是到官網(wǎng)去下載呀？M1
都可以
需要安裝的軟件有安裝位置的要求嗎？必須c盤或者也可以其他盤？
R語(yǔ)言和Rstudio要安裝C盤，其他沒有要求
在R studio里安裝package 需要同時(shí)把R打開嗎
不需要
這個(gè)選項(xiàng)是選yes吧？
是的
老師，我電腦里有舊版本的R是直接卸載還是覆蓋安裝新版本的？
可以直接安裝新版本
我安裝R包時(shí)經(jīng)常出現(xiàn)這種說(shuō)某一個(gè)包是舊版本安裝的 需要重新安裝，這有沒有更好的辦法解決 還是只能手動(dòng)重新安裝 因?yàn)槲矣龅竭^(guò)非常多的這種錯(cuò)誤
網(wǎng)絡(luò)問題，你缺一個(gè)dbi包，你安裝我們給你的包的時(shí)候，他需要順便安裝幾十個(gè)其它依賴包，但這個(gè)過(guò)程是自動(dòng)的，如果你網(wǎng)絡(luò)比較差，很有可能在其中某一個(gè)包失敗，你現(xiàn)在的問題就是dbi失敗了，所以你需要單獨(dú)把它重新給裝起來(lái)
在使用limma 構(gòu)建design的時(shí)候，這個(gè)公式的0是什么含義呢？
design
design2
可以參考
老師，這個(gè)問題怎么弄，直接跳過(guò)？
跳過(guò)就好，你一行行run之后，最后面library代碼運(yùn)行沒有error就好了
網(wǎng)絡(luò)是國(guó)外的
那就重啟一下Rstudio，然后跳過(guò)前面option 的代碼
老師這個(gè)包我裝不上，把包下下來(lái)本地裝也裝不上
單獨(dú)運(yùn)行這一句代碼 ::install('GO.db')
請(qǐng)問老師，C盤路徑有中文，R和R studio下載和卸載過(guò)幾次了，安裝到D盤了，文件默認(rèn)位置還是C盤，現(xiàn)在需要把之前的卸載，安裝新的到C盤這個(gè)位置嗎？
C盤路徑有中文，應(yīng)該也是可以安裝R和Rstudio，只是安裝R包會(huì)有一些問題，但都可以解決的。你這個(gè)截圖，顯示的是工作目錄在C盤，即便是有中文，也沒有關(guān)系。而且和你說(shuō)的安裝在C盤還是兩回事。建議你還是卸載干凈，重新安裝到C盤，就是默認(rèn)的安裝路徑就好，然后按照視頻說(shuō)的，安裝R包，一般有中文也是可以解決的，你遇到問題再截圖群里提問即可
請(qǐng)問老師我這一推warning有影響嗎？
你的已經(jīng)成功啦~~你的是之前使用了國(guó)外網(wǎng)絡(luò)，所以設(shè)置清華鏡像反而不對(duì)，就是直接跳過(guò)設(shè)置清華鏡像的代碼，就可以安裝R包的
老師好，我有幾個(gè)R包成功，幾個(gè)不成功，該怎么處理呢
找到error包對(duì)應(yīng)的install代碼，重新運(yùn)行安裝一下
請(qǐng)問老師，c盤路徑有中文，安裝的位置沒有找到。需要把路徑改為中文嗎
把中文改掉，路徑需要英文
老師好，我在C盤新建了一個(gè)文件夾，把TEMP TMP修改了，然后需要重新跑一遍代碼嗎
需要，重新安裝看看
老師好，請(qǐng)問該如何尋找對(duì)應(yīng)的install代碼呢？我按照網(wǎng)上的方法試了試，還是不行
用 ::install('')
老師 想請(qǐng)問一下運(yùn)行了“l(fā)ibrary()”出現(xiàn)這種報(bào)錯(cuò)該怎么辦呢 已經(jīng)嘗試重新運(yùn)行的install代碼了
安裝一下提示信息說(shuō)的安裝 包
麻煩老師看下這是怎么回事，點(diǎn)擊是，后面也報(bào)錯(cuò)
關(guān)掉Rstudio，然后用管理員身份打開，再安裝
運(yùn)行截圖的第14行代碼
老師好，我按照這個(gè)跑了一下，最后又跑了所有代碼，這樣是可以了嗎？但是只有這個(gè)，而GSVA和都沒有
截圖顯示還在運(yùn)行中，等左下角窗口返回一個(gè)大于號(hào)，你再選擇最后的 library代碼，run一下
運(yùn)行l(wèi)ibrary()出來(lái)又是一堆新錯(cuò)誤
提示信息，并不是錯(cuò)誤，沒有關(guān)鍵詞 error 就不用管
運(yùn)行 ::install('DO.db')
老師，我安裝的是微云的4.1.0的R，安裝包的時(shí)候出現(xiàn)這個(gè)情況，是需要換其他版本嗎？
看答疑文檔Q15,16
老師，請(qǐng)問上課時(shí)需要操作么？需要準(zhǔn)備2臺(tái)電腦么
需要邊操作，如果有條件的話，可以準(zhǔn)備多臺(tái)設(shè)備。當(dāng)然，一臺(tái)也夠用了
重新安裝一下
老師好，這兩個(gè)R包還是一直安裝不了
先切換鏡像。
r語(yǔ)言最新鏡像
options(="")
options("repos" = c(CRAN=""))
options(.file.method = 'libcurl')
options(url.method='libcurl')
::install("",ask = F,update = F)
::install("topGO",ask = F,update = F)
::install(".db",ask = F,update = F)
我看完公眾號(hào)推文后意識(shí)到之前下載R時(shí)改變了默認(rèn)的下載位置，改動(dòng)到了E盤里，請(qǐng)問這對(duì)后續(xù)的使用有影響嗎，如果現(xiàn)在想改的話是直接剪切粘貼，還是卸載掉重新安裝好點(diǎn)呢？
你現(xiàn)在C盤還有多少空間，一般有10G就夠用了，如果你現(xiàn)在用著沒什么問題，也可以，只是以后可能會(huì)遇到問題。現(xiàn)在改的話卸載重裝就好
老師，請(qǐng)問一下現(xiàn)在有問題還是在騰訊文檔里截圖反饋嗎？什么時(shí)候會(huì)獲得答疑呢
如果是練習(xí)題，就在騰訊文檔貼截圖，下節(jié)課會(huì)講；如果是對(duì)某個(gè)知識(shí)點(diǎn)不理解，可以在群里提問
打擾了，盼老師空時(shí)幫忙解答一下，謝謝
單獨(dú)運(yùn)行一下 order(score) 就知道答案啦，另外，要改變順序，也有參數(shù)
老師，為什么這個(gè)邏輯性數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成數(shù)字型的顯示的1？
向量只能保存一種數(shù)據(jù)類型，數(shù)值型和邏輯型同時(shí)出現(xiàn)時(shí)，邏輯型會(huì)轉(zhuǎn)換成數(shù)值型，TRUE 會(huì)變成 1，F(xiàn)ALSE 變?yōu)?0
老師，R包這是安裝成功了嗎？
是的
老師，問下R包安裝以后是自動(dòng)保存嗎？關(guān)閉了這個(gè)studio是不是還在
R包安裝以后是自動(dòng)保存的，還在
請(qǐng)問我安裝包時(shí)出現(xiàn)了warning提示，對(duì)后續(xù)使用有影響嗎
沒有影響
DNA測(cè)序是不是不能直接測(cè) dna，直接測(cè)的rna呢？我看二代測(cè)序的原理，測(cè)的好像都是dna擴(kuò)增，dna測(cè)序，但是實(shí)際上是不是rna轉(zhuǎn)為dna再測(cè)序的
是rna反轉(zhuǎn)錄為cdna再測(cè)序，因?yàn)閞na不穩(wěn)定不能進(jìn)pcr儀加熱
請(qǐng)問一下，這里DESeq2安裝為什么出錯(cuò)呀
rlang需要升級(jí)
請(qǐng)問在這道題中y$和（y）有區(qū)別嗎？
單獨(dú)看y$colname的運(yùn)行結(jié)果，啥也沒有，提取列名不是這樣操作的，自創(chuàng)語(yǔ)法無(wú)效
老師，為什么我自己建的CSV放到工作目錄下打不開，而另一個(gè)卻可以打開
文件名里有個(gè)空格
謝謝老師，確實(shí)名字里帶個(gè)空格，但是去掉后再讀取，又出現(xiàn)個(gè)這
文件不規(guī)則，不是個(gè)方方正正的表格
老師，這個(gè)代碼運(yùn)行不出來(lái)，怎么一直有加號(hào)？
要一下ESC鍵，括號(hào)不成對(duì)或者引號(hào)不成對(duì)
老師，請(qǐng)問一個(gè)向量要生成矩陣時(shí)，只設(shè)置行數(shù)，默認(rèn)的列數(shù)是怎樣的？（已發(fā)現(xiàn)會(huì)循環(huán)補(bǔ)齊）當(dāng)向量長(zhǎng)度大于設(shè)置的行數(shù)時(shí)
向量的長(zhǎng)度除以你設(shè)置的行數(shù)或列數(shù)，向上取整進(jìn)行循環(huán)補(bǔ)齊的
老師 72行代碼運(yùn)行后y的列名沒有改變?cè)趺椿厥卵剑?4行代碼運(yùn)行后是對(duì)的
因?yàn)闆]賦值，沒賦值就是沒改
老師請(qǐng)問一下如何把標(biāo)尺放在底部，做出類似下圖的效果，沒搜到要用哪個(gè)函數(shù)
右邊那個(gè)是圖例，不是標(biāo)尺，然后你圖里畫的那個(gè)東西，它也不是正常這樣畫上去的，有可能是用Ai P上去的。
小潔老師，我能請(qǐng)教下截圖懸浮的工具叫什么嗎？
老師好，我在安裝eoffice包的時(shí)候遇到了如圖的報(bào)錯(cuò)，然后我安裝了magick和Rcpp包之后重新加載eoffice包，就一直顯示正在運(yùn)行l(wèi)ibrary(eoffice)命令（等了半個(gè)小時(shí)還是正在運(yùn)行），如果中止命令或者強(qiáng)行退出r，再次重新library(eoffice)又會(huì)出現(xiàn)第一次的報(bào)錯(cuò)，請(qǐng)問該怎么辦呢
管理員方式打開rstudio
這是因?yàn)殡娔X上M1 Pro的cpu么
沒有安裝 X11，OS X 10.9已不再提供此軟件
需要從下載安裝
這頁(yè)ppt里面：：是代表不加載。但是不加載的話，后面的函數(shù)為什么能用？
你不加載 r不知道你要用啥函數(shù)，但你指定了具體的R包，他就知道了
老師，想請(qǐng)教個(gè)問題，數(shù)據(jù)b的結(jié)構(gòu)和代碼如圖。但是運(yùn)行出來(lái)的圖片都是空的，畫出來(lái)的圖個(gè)數(shù)是對(duì)的。如果單次給gene賦值，畫出的一張圖是對(duì)，想知道代碼哪里出錯(cuò)了
畫圖的代碼里沒有print
這個(gè)怎么解決？要手動(dòng)下載嗎？
是的，先單獨(dú)安裝這個(gè)包
命令是::install("DO.db")
請(qǐng)問老師，在geo上找到的sra文件，是不是這里寫了“2 reads per spot”就代表測(cè)序方法是pair-end測(cè)序
你要看這里是single還是paired，這個(gè)就是paired
這種public data 要怎么知道adapter怎么trim，如果文章里沒有寫的話…下載的srr是原始數(shù)據(jù)，做之前應(yīng)該是要trim adapter吧？
如果文章里沒有提供adapter的話，就按照他是 adapter處理就好，用默認(rèn)的方式處理。比如fastp之類的工具。
怎么可以看出來(lái) 這個(gè)是什么類型的數(shù)據(jù)呢 是芯片數(shù)據(jù) 還是rna-seq 還是其他
array是芯片，是測(cè)序，RNAseq數(shù)據(jù)一般是高通量測(cè)序獲取的。
請(qǐng)問老師，如果以后自己的課題中探針注釋在這個(gè)網(wǎng)址里面找不到，該怎么辦？這里面總結(jié)了78個(gè)芯片
注釋和ppt里都有
剛才離開后斷網(wǎng)，再次進(jìn)去服務(wù)器又出現(xiàn)密碼輸進(jìn)去又提示要輸密碼。
你可以點(diǎn)左下角的記住密碼，這樣就可以不用每次重新輸入。或者試試填表法
請(qǐng)問老師，我在練習(xí)2里面遇到了報(bào)錯(cuò)
文件名用 tab 補(bǔ)全，凡是手打的文件名都是錯(cuò)的， Data.tar.gz 不是 Data.rar.gz
老師，問下我做的練習(xí)最后要合成圖片，生成deg文件為啥是空的，也沒有圖出來(lái)？
還有一句dev.off你沒運(yùn)行
小潔老師，我看生信技能樹公眾號(hào)您寫的一篇文章，講的是怎么處理GPR格式的原始數(shù)據(jù)（鏈接：），我按照代碼跑了一遍，最后生成的deg文件行名有點(diǎn)像，不太確定？
看樣子就是Entrez ID，可以查看一下這個(gè)
你也可以查看一些管家基因，他們應(yīng)該高表達(dá)
在臨床信息里面找不到分組信息是不是就不能做差異性分析啦？
分組是自己的事情，跟代碼無(wú)關(guān)，如果你沒辦法分組當(dāng)然就沒辦法差異。都是胃癌，也有中晚期分組，性別分組，你給它一個(gè)免疫評(píng)分， 然后就是免疫高低分組了
老師好，我是Windows系統(tǒng)，在登錄Linux服務(wù)器的時(shí)候用命令行法和填表法登錄都連接不上，也沒有出現(xiàn)彈窗，請(qǐng)問是哪里出問題了呢
換個(gè)網(wǎng)絡(luò)環(huán)境
老師，問下作業(yè)里有道題，cp這個(gè)怎么復(fù)制不成功？
你的findMe.txt很可能是一個(gè)文件夾，只是你沒注意到
請(qǐng)問各位老師同學(xué)，如果數(shù)據(jù)里面有負(fù)值，GEO數(shù)據(jù)庫(kù)也沒有RAW data, 這種數(shù)據(jù)還有再開發(fā)的可能么？
沒有。20年前的芯片，早就停產(chǎn)了，而且他使用頻率很低，就沒有人給他開發(fā)配套的資料，這樣的芯片拿到也沒辦法。
老師，我在R4的環(huán)境中安裝R包之后library，發(fā)現(xiàn)有個(gè)error，該怎么處理呢
缺啥補(bǔ)啥就好，如果用conda安裝的話，conda install r-rvcheck；可以通過(guò)搜索關(guān)鍵字找到安裝的命令和在conda里這個(gè)包的名字
老師 我使用網(wǎng)頁(yè)安裝之后發(fā)現(xiàn)salmon包可以--help成功，但是當(dāng)我切換環(huán)境回來(lái)之后發(fā)現(xiàn)還是報(bào)錯(cuò)了，包括安裝install -ng=9.1.0也沒用
看看error.pdf 有類似的報(bào)錯(cuò)，你還缺了一步
我網(wǎng)頁(yè)安裝的R4環(huán)境，然后想使用R的方法安裝，彈出了這個(gè)提示：關(guān)于這個(gè)文件夾貌似沒有權(quán)限，所以我可以進(jìn)一步點(diǎn)yes來(lái)用個(gè)人文件夾來(lái)代替嗎
可以
我換了好幾個(gè)地方的源了，還是很卡
你截圖顯示只換了CRAN，沒有換
老師，關(guān)于昨天的課程有兩個(gè)問題。1.開始單獨(dú)安裝的conda install -y -ng=9.1.0，結(jié)果失敗并提示（這邊沒來(lái)得及截圖，刷屏信息太多翻不上去了），后來(lái)其他所有的都安裝好了，又回來(lái)試了一遍conda install -y -ng=9.1.0，顯示如圖，是不是安裝好了？但是我conda list查看-ng的版本并不是9.1.0，所以算安裝成功沒？
調(diào)用我們要用的軟件幫助文檔，salmon，hisat2等，沒有報(bào)錯(cuò)就可以了
conda配置好以后 .condarc 存在于文件夾的上一級(jí)目錄中，能不能把.condarc 放入文件夾下（單純強(qiáng)迫癥心理想條理一點(diǎn)）
不可以，隱藏文件 .condarc 是配置文件，有特殊作用，不可以移動(dòng)
conda命令屬于shell，怎么能在R里運(yùn)行呢？需要去shell里面哦
15號(hào)那天的最后一部分內(nèi)容，二進(jìn)制文件安裝，源代碼安裝，java編譯的軟件，聽不懂看不懂，對(duì)下周轉(zhuǎn)錄組的課程影響大嗎？
不大
老師我想寫一個(gè)當(dāng)i=1時(shí)返回Hi，當(dāng)i>1時(shí)返回i的命令，您能幫我看看哪里出問題了嗎，謝謝
這里是多了一個(gè)fi
讀取文件使用 fread函數(shù)
安裝遇到的問題。您看下可以幫我解決嗎？
github上有這個(gè)報(bào)錯(cuò)的解決方案
install.("",type = 'source',repos = NULL)
先解決這個(gè)error
老師，請(qǐng)問一下我們平時(shí)運(yùn)行shell文件是推薦用Rstudio，還是xshell啊，我看其他老師的擴(kuò)增子測(cè)序都是在用rstudio運(yùn)行shell文件
我們比較少這么用，而且這和個(gè)人習(xí)慣有關(guān)
老師，GO富集的時(shí)候怎么讓BP,CC,MF都出現(xiàn)，小潔老師給的代碼只出來(lái)BP和MF
cc可能是沒有富集到
老師好，我在小環(huán)境中安裝小軟件的時(shí)候第一個(gè)用的是手動(dòng)安裝的，第二個(gè)R4想通配置文件安裝，但是顯示出這樣的，問下咋回事？
你要先把 R4.yaml 文件保存到當(dāng)前文件夾下
老師為啥我的geneid還有小數(shù)點(diǎn)
因?yàn)間tf文件中的geneid有小數(shù)點(diǎn)
老師，請(qǐng)問的比對(duì)率低于多少屬于結(jié)果不太好呢？上課的例子比對(duì)率是80%左右，小娟老師說(shuō)這是屬于好的，老師請(qǐng)問這種有規(guī)定的范圍嗎？
沒有，主要看什么物種，而且還要看你的測(cè)序技術(shù)和樣本類型，而且的結(jié)果并不是比對(duì)率，應(yīng)該是assign率哦。
文末友情宣傳
強(qiáng)烈建議你推薦給身邊的博士后以及年輕生物學(xué)PI，多一點(diǎn)數(shù)據(jù)認(rèn)知，讓他們的科研上一個(gè)臺(tái)階：