在進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析時(shí)，生成樹文件后fig文件用什么打開，往往需要軟件進(jìn)一步對樹文件進(jìn)行展示美化，編輯樹文件的軟件以及在線網(wǎng)站很多，這里介紹一款簡便好用的進(jìn)化樹編輯軟件——。是一款系統(tǒng)樹文件的圖形查看器，可以打開NEXUS 和格式的樹文件，能夠直接展示BEAST結(jié)果文件。
下載地址：
使用方法：
1、導(dǎo)入樹文件：通過File——Open導(dǎo)入樹文件（*.tre, *.tree, *.等文件）；
2、布局設(shè)置
a.默認(rèn)是矩形樹狀圖，可以通過最上面的三個(gè)矩形框改變樹的形狀；
b.zoom , 和Fish Eye用來放大或者縮小分枝，其中用來增加每個(gè)分枝間的縱向間距；
c.Root 為調(diào)整根節(jié)點(diǎn)的長度，為可以用來調(diào)整樹圖的彎曲角度，下圖為設(shè)置最大值時(shí)的樹圖形狀；
d.Align Tip 用來設(shè)置是否需要標(biāo)簽名對齊；
3、 設(shè)置：改變樹枝的顏色，粗細(xì)及背景顏色等
這里設(shè)置樹枝線條寬度設(shè)為1，且按照著色，分枝背景顏色設(shè)為漸近色，效果圖如下：
4、Trees設(shè)置：設(shè)置樹根，子結(jié)點(diǎn)順序已經(jīng)分枝長度
設(shè)置效果圖如下
5、Tip, Node和設(shè)置：可以用來設(shè)置標(biāo)簽字體顏色等，以及是否需要添加結(jié)點(diǎn)形狀
這里的tip以樣本名作為標(biāo)簽fig文件用什么打開，字體設(shè)置為12號(hào)，tip形狀設(shè)為；Node標(biāo)簽設(shè)置, 字號(hào)設(shè)置10, 格式為小數(shù)點(diǎn)后保留四位數(shù)，Node形狀為；標(biāo)簽設(shè)置為 times, 格式與Node標(biāo)簽相同，具體設(shè)置與效果圖如下
6、坐標(biāo)軸及標(biāo)簽設(shè)置
這里添加scale bar, 坐標(biāo)線以及的圖例，效果圖如下
7、輸出圖形: File—— 輸出當(dāng)前的圖形，可以保存為Trees, PDF, SVG,PNG和JPEG格式
本期的軟件使用方法就介紹到這里，下期將為大家介紹宏病毒的研究過程，敬請關(guān)注！
供稿人：微生物事業(yè)部 韓娜